Και φυσικά φιλοξενεί ένα από τα πιο εκπληκτικά οικοσυστήματα του πλανήτη (περίπου 1.340 είδη ζώων και 570 είδη φυτών, εκ των οποίων τα 745 είδη ζώων και τα 150 φυτά δεν υπάρχουν πουθενά αλλού στον πλανήτη).
Ένας αστροναύτης κατάφερε να τραβήξει μια εντυπωσιακή φωτογραφία της λίμνης (φωτο εξωφύλλου) από το διάστημα (από το Διεθνή Διαστημικό Σταθμό). Η φωτογραφία αποτυπώνει το φαντασμαγορικό φαινόμενο του sunglint , δηλαδή του καθρεφτισμού του φωτός σε μια επιφάνεια.
Η επιφάνεια αντανακλά πλήρως το φως που δέχεται. Συμβαίνει συχνά σε υδάτινες επιφάνειες όπως σε ποτάμια, λίμνες και στους ωκεανούς ενώ η απόχρωση της αντανάκλασης εξαρτάται από την τραχύτητα της επιφάνειας στην οποία γίνεται.
Η Βαϊκάλη είναι μνημείο φυσικής κληρονομιάς χαρακτηρισμένο από την UNESCO.
Ωστόσο απειλείται από την υπεράντληση υδάτων, τη μόλυνση των νερών αλλά και την άνοδο της θερμοκρασίας.
